Podporucznik rezerwy, syn Stanisława i Marianny z domu Wojczak, urodził się 20 kwietnia 1910 roku w Poznaniu. Absolwent Szkoły Podchorążych Rezerwy Sanitarnej w Warszawie. Przydzielony do 29. Pułku Piechoty, następnie do Szpitala Okręgowego. Podporucznikiem mianowany ze starszeństwem 1 stycznia 1936 roku. Od 1937 roku w 55. Pułku Piechoty.
Uczęszczał do gimnazjum, a potem Liceum im. Karola Marcinkowskiego w Poznaniu. Matura 1928 rok. Absolwent Uniwersytetu Poznańskiego z 1934 roku. Po studiach pracował jako lekarz w Urzędzie Wojewódzkim z Poznaniu, na placu Kolegiackim oraz w pogotowiu przy ul. Fredry w Poznaniu. Lekarz internista. Po ślubie prowadził prywatną praktykę w Poznaniu.
Żonaty z Janiną (zwaną Rudi), bezdzietni.
Jeniec obozu NKWD w Kozielsku, zamordowany i pochowany w Katyniu. Lista wywózkowa numer 040/3 z 20 kwietnia 1940 roku. Rozstrzelany 23-24 kwietnia 1940 roku.
Postanowieniem Prezydenta Rzeczypospolitej Polskiej Lecha Kaczyńskiego z 5 października 2007 roku awansowany pośmiertnie na stopień porucznika.
Pośmiertnie odznaczony Krzyżem Srebrnym Orderu Virtuti Militari oraz Kampanii Wrześniowej 1939 roku.
Florian Nowakowski został upamiętniony na tablicy pamięci „Mieszkańcy województwa poznańskiego – ofiary ludobójstwa katyńskiego” w kaplicy św. Józefa kościoła pw. św. Jana Kantego w Poznaniu (19.09.2017).
Wg list ekshumacyjnych i dokumentów Zarządu Głównego Polskiego Czerwonego Krzyża przy nierozpoznanym ciele Floriana Nowakowskiego znaleziono: notes oraz świadectwo szczepienia w Kozielsku o numerze 1303 (0921).
Florian Nowakowski prowadził swój notes-kalendarzyk (z przerwami) do samego końca. Przy dacie 3.IV.1940 zanotował „Początek wyjazdów”, a pod datą 22.04.1940 – „godz. 17:00 wyjazd z Kozielska”.
Literatura:
Katyń, Księga Cmentarna Polskiego Cmentarza Wojennego [1]
Postanowienie nr 112-48-07 Prezydenta RP z dnia 5 października 2007 r. [19]
Zabici w Katyniu, Indeks represjonowanych, tom XXI [30]
Mój Ojciec, tom 1 [249]